液相色譜使用中基線噪聲一般由以下三種原因引起：1氘燈壽命氘燈壽命到了時，基線不穩定有噪聲產生。氘燈發射出的光的強度不穩定，就象日光燈壽命終止時亮度在不斷變化。計算一下使用的時間或看一下計時器即可判斷。現象：基線呈或上或下的無規則變化。

　　2檢測池內有氣泡流動相流動時，引起微小氣泡的抖動，光強隨著變化(氣體與流動相對波長的吸收度不同)。排除方法：將池子液體出口處用吸耳球的任何部位堵住，此時，壓力顯示會增加一點，氣泡被壓縮很小很小，然后突然松開，氣泡會突然膨脹隨液體流出，反復多次即可排除。

　　3池子內污染有微小的顆粒隨流動相的流動在晃動，引起吸收值的變化。檢查方法：取下池子，用吸耳球吹凈池內的液體，在陽光下觀察池內情況，必要時拆開清洗。污染物的來源大致是樣品長期累積、柱填料流出等。

　　以上三種情況可以這樣進行判斷：泵停止運轉，分別觀察參比值R、測量值S的穩定性，方法是分別按下參比鍵、測量鍵不動，顯示值在變化(R值和S值)，可以判斷氘燈是否有問題，壽命是否終止期到了。如果R值很穩定，S值不穩定(此時泵正常運轉)則判斷池體內有氣泡或污染。